NDKmol

Visualizzatore molecolare veloce che supporta proteine, acidi nucleici e piccole molecole.

NDKmol - Visualizzatore molecolare per Android

== Informazioni ==

NDKmol è un visualizzatore molecolare per Android. È possibile visualizzare le strutture tridimensionali di proteine, acidi nucleici e piccole molecole. NDKmol supporta la maggior parte delle rappresentazioni comuni per le molecole, come ad esempio nastro, traccia, bastone, sfera e la linea. NDKmol supporta anche operazioni di simmetria; assemblee biologici e l'imballaggio di cristallo possono essere visualizzati. È possibile cercare e scaricare strutture da RCSB PDB e NCBI PubChem.

NDKmol ha quasi stesse funzionalità GLmol, che è scritto in

WebGL / Javascript e gira su browser web. Si può provare a GLmol http://webglmol.sourceforge.jp/index-en.html

== Caratteristiche ==

* Read PDB o file SDF / MOL

* Ruota / Tradurre / Zoom modello da dito

* Rappresentazioni

    - Linea

    - Stick

    - Sfera (van der Waals raggio)

    - Alpha traccia di carbonio

    - Ribbon (sottile o spessa)

    - Strand

    - B tubo fattore

    - Scaletta di acido nucleico

    - Linea di acido nucleico

    - Solvente 'stelle'

* Livellamento dei beta-fogli

* Colorare

    - Per catena

    - Per struttura secondaria (quando definito nel foglio / HELIX record)

    - Da elementi

    - Gradazione (a.k.a chainbow)

    - Fattore B

    - Polare / non polare

* Cristallografia

    - Visualizzazione cella unitaria

    - Mostra di imballaggio di cristallo (quando definito nella sezione NOTA)

    - Visualizzare il montaggio biologico (quando definito nella sezione NOTA)

== Come usare ==

Una volta lanciato, NDKmol carica automaticamente Porin (PDBID: 2POR) come esempio. È possibile ruotare la molecola di un dito.

Per ingrandire o tradurre la molecola, premere il tasto MENU nel telefono / tablet e selezionare la modalità. Sono supportate anche le due dita.

Tutto il resto può essere fatto dal menu.

Per caricare altri file PDB, si prega di mettere il file nella directory "PPB" della scheda SD e selezionare il comando "Apri" nel menu. È anche possibile scaricare direttamente da strutture RCSB PDB e NCBI web server PubChem. Selezionare "Search and Download" nel menu.

== Contatti ==

Sito web del progetto si trova a http://webglmol.sourceforge.jp/. È possibile ottenere i codici sorgente di questo programma da qui.

Commenti e suggerimenti sono i benvenuti al http://sourceforge.jp/projects/webglmol/forums/ o biochem_fan@users.sourceforge.jp

Licenza d'uso === ===

NDKmol stessa è sotto licenza GNU Lesser General Public License come segue.

Tuttavia, i file PDB inclusi come esempi sono in condizioni diverse.

Si prega di consultare

http://www.rcsb.org/pdb/static.do?p=general_information/about_pdb/pdb_advisory.html

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NDKmol - Visualizzatore molecolare per Android

     (C) Copyright 2011, biochem_fan

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     ma SENZA ALCUNA GARANZIA, nemmeno la garanzia implicita di

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     Dovreste aver ricevuto una copia della GNU Lesser General Public License

     insieme a questo programma. In caso contrario, vedere .