Gelapp: DNA&Prot Gel Analyzer

Il 1 ° app android per analizzare gel (agarosio e PAGE) bande con scala log

* In linea con le modifiche del SO Android, si prega di accedere ai file locali usando ES File Explorer, che farà il root delle schede drive / SD. È necessario accedere a ES File Explorer per eseguire prima il rooting. Tieni presente che il supporto Dropbox viene rimosso a causa di modifiche in Android e Dropbox.

Questa è la prima app per Android che consente di analizzare le bande di gel (sia agarosio che PAGE) con un grafico di registro generato automaticamente dai marcatori. Consente il rilevamento e il caricamento automatici per usi futuri. Utilizzando il filtro Gabor, questa app consente agli utenti di migliorare automaticamente il rilevamento delle bande. Per immagini di scarsa qualità, gli utenti possono fare clic su può disegnare manualmente una casella sulla banda desiderata o fare clic sull'immagine per determinare la posizione specificata.

Le immagini possono essere caricate dalla galleria o dalla casella personale, rendendola molto comoda. Le immagini migliori sono quelle generate dagli scanner, ma funzioneranno con foto scattate dalle telecamere mobili.

Le foto dovrebbero essere prese su un piano diretto con il gel.

Le caratteristiche di questa app includono:

1) Specifica di agarosio o PAGINA.

2) Identificazione del colore delle bande marker per PAGE.

3) Filtri di imaging avanzati - Garbor.

4) Elaborazione automatica delle immagini con input utente personalizzato, se necessario.

5) Salvataggio delle impostazioni per l'elaborazione delle immagini per comodità futura.

6) Salvataggio dei marker per comodità futura quando si usano gli stessi marker.

7) Interfaccia utente semplice e basata su pulsanti.

8) Rilevamento automatico delle bande.

9) Casella di delimitazione semplice definita dall'utente.

10) Log grafico dell'indicatore generato automaticamente.

11) Posizione definita dall'utente di bande specifiche.

12) Compatibilità con la visualizzazione orizzontale e verticale di tablet e smartphone di dimensioni multiple.

13) Compatibilità con le funzioni di screenshot di gel analizzati e log graph smartphone e tablet per pubblicazioni o report.

14) Letture visualizzate nell'immagine gel con caselle evidenziate e dimensioni di banda calcolate.

15) Funzione di ritaglio per immagini prima dell'analisi.

16) Modifica funzione per rimuovere le bande indesiderate.

17) Diverse caselle colorate per marcatori e bande.

18) Accesso diretto semplice alla galleria di immagini per immagini.

19) Compatibile con l'analisi del gel di agarosio Sybr Green, EtBr.

20) Accesso diretto alla telecamera.

Vantaggi dell'utilizzo di questa app per pubblicazioni

1) Porta maggiore accuratezza all'analisi del gel invece di basarsi su approssimazioni.

2) Il valore si aggiunge a pubblicazioni e report.

3) Strumento didattico utile per gli studenti di scienze.

4) Analisi semplificata, riducendo l'errore umano e la soggettività: ora puoi fidarti dei valori riportati dai tirocinanti e dal personale meno esperto!

5) Analisi in movimento con lo smartphone / tablet.

6) Analisi automatizzata: non è necessaria la carta millimetrata e la trama noiosa.

7) L'app è GRATUITA!

8) L'app è autonoma, non è necessario l'accesso a Internet (tranne che per l'analisi di dropbox).

Gli utenti di Android 6 possono ottenere immagini dalla galleria locale "Immagine". Gli utenti di versioni precedenti di Android avranno il supporto per DropBox. Ciò è dovuto a modifiche in Android 6 ed è al di fuori del nostro controllo.

Per istruzioni sull'uso, guarda il video all'indirizzo https://www.youtube.com/watch?v=Chlzhy8d_KA&feature=youtu.be

Userguide disponibile in pdf su http://tinyurl.com/GelApp

* Gli ultimi telefoni, ad es. Samsung Note 8 potrebbe avere problemi con il salvataggio della fotocamera. Se ci sono tali problemi, usa la galleria.

Per citare, si prega di utilizzare:

Sim, JZ. *, Nguyen, PV. *, Lee, HK., Gan, SKE. (2015). GelApp: analizzatore di elettroforesi su gel mobile. Note sull'applicazione dei metodi naturali. doi: 10.1038 / an9643

O al software direttamente nell'App store

Sim, J.Z., Nguyen, P.V., Gan, S.K.E. (2014) GelApp: DNA & Prot Gel Analyzer v1.2. [Software per applicazioni mobili]. Estratto da https://play.google.com

Questa applicazione è un prodotto del Laboratorio di sviluppo anticorpi e prodotti, Divisione di ricerca traslazionale, Istituto di Bioinformatica, Agenzia per la scienza, la tecnologia e la ricerca, Singapore.

I creatori sono: Sig. SIM Jia Zhi, Sig. NGUYEN Phi Vu e Dott. Samuel GAN.

                    (Poly intern) (Research Officer) (Assistant Principal Investigator)